Ποινική δίωξη σε βάρος όλων όσοι σχετίζονται με την κατάρτιση της συμφωνίας για την οριοθέτηση των θαλάσσιων συνόρων με την Ελλάδα, άσκησε η Εισαγγελία των Τιράνων, σύμφωνα με τα αλβανικά ΜΜΕ. Η όλη διαδικασία κινήθηκε ύστερα από σχετική καταγγελία του αλβανικού Υπουργείου Εξωτερικών, που ζήτησε την ποινική δίωξη των υπευθύνων για την υπογραφή της εν λόγω συμφωνίας, το 2009. Οι εισαγγελείς -σύμφωνα με τις ίδιες πληροφορίες- προχώρησαν στη διερεύνηση της υπόθεσης μετά την παραχώρηση του σχετικού υλικού από το υπουργείο Εξωτερικών και κατέληξαν στο συμπέρασμα ότι υπάρχουν επαρκή στοιχεία, τα οποία επιβεβαιώνουν την παραβίαση του Άρθρου 210 του Ποινικού Κώδικα της Αλβανίας.
Σύμφωνα με το ΑΜΠΕ το εν λόγω Άρθρο προβλέπει ότι για ποινικά αδικήματα που αφορούν υπογραφή συμφωνιών με ξένα κράτη, με αποτέλεσμα μερική ή ολική εκχώρηση επικράτειας (παραβίαση εδαφικής ακεραιότητας), η ποινή φυλάκισης είναι από 5 μέχρι 10 χρόνια. Η Εισαγγελία Τιράνων αναμένεται να καλέσει 11 εμπειρογνώμονες της διαπραγματευτικής ομάδας που συμμετείχαν στη σύνταξη της συμφωνίας, χωρίς ωστόσο να επιβεβαιώνεται, μέχρι στιγμής, αν η σχετική λίστα περιλαμβάνει και το όνομα του τότε υπουργού Εξωτερικών Λουλεζίμ Μπάσα.